Caractérisation moléculaire

Caractérisation moléculaire (Certification ISO 9001:2015)

La taxonomie des parasitoïdes oophages en général et des espèces du genre Trichogramma peut s'avérer délicate. Dans ce contexte, leur caractérisation moléculaire peut s'avérer utile voire indispensable. Dans ce cadre, le CRB EP-Coll offre un service de caractérisation moléculaire basée sur le séquençage d’une portion du gène mitochondrial cytochrome oxydase I (COI) (processus certifié ISO9001:2015 R1).

En plus de (i) la restitution des séquences valides obtenues (format FASTA), du rapport d’analyse transmis par le CRB EP-Coll inclut également des éléments de contextualisation, notamment (ii) un positionnement des séquences obtenues dans un arbre Nebour-Joining incluant des séquences publiques ou propres au CRB EP-Coll et (iii) des informations (publiées ou non) obtenues par le CRB EP-Coll par d’autres approches (phylogénie multi-locus, croisements). Les résultats des analyses sont donnés "en règle générale" dans un délai d'un mois après la réception du matériel biologique et la finalisation des documents d’accompagnement.

Pour de plus amples informations, merci de contacter : crb-ep-coll@inrae.fr

Arbre Neighbour-Joining COI (Warot S - Mémoire EPHE 2018)

Arbre_NJ - COI

Date de modification : 19 juin 2023 | Date de création : 31 octobre 2018 | Rédaction : RIS N & WAROT S